Formatuj w aparacie, tylko wtedy będzie 'dobrze'.

Ogólnie staram się formatować karty zawsze po zgraniu z nich zdjęć. Wybieram wtedy NTFS i największy dostępny rozmiar jednostki alokacji. Jednak robię to tylko po to, żeby karta była czysta - taki szybszy sposób kasowania karty.

Zawsze po włożeniu karty do aparatu formatuję ją z poziomu aparatu, Tobie też to polecam, to jeden z elementów "dobrych praktyk".